CV d'ingénieur R & D en biologie moléculaire de Thomas Guiraud

Depuis 2021

Ingénieur de recherche au Département "Feed & Food" de Bordeaux Sciences Agro à Gradignan (Gironde, France). Responsable : Patrick SAUVANTPatrick SAUVANT [patrick.sauvant@agro-bordeaux.fr].
- Missions de transfert pour le compte des entreprises Cobiotex, Dietaxion et Via végétale.
- Missions de transfert pour le compte des entreprises Cobiotex, Dietaxion et Via végétale.
Compétences/techniques mises en œuvre : Gestion de projet, Microbiologie moléculaire & pasteurienne, Encadrement d'étudiants.

Contrats droit public financés, via l'école Bordeaux Sciences Agro, par les partenaires industriels.
2017 - 2021

Ingénieur de recherche dans l'équipe "Géoressources et Environnement" de Bordeaux Sciences Agro à Gradignan (Gironde, France). Responsable : Philippe CHÉRYPhilippe Chéry [philippe.chery@agro-bordeaux.fr].
- Chargé de projets portant sur l'inventaire des zones humides de Bordeaux Métropole (BiodiverCité) puis sur la modélisation des risques d'émissions de gaz à effet de serre suite aux feux de forêt (REMAS).
- Implémentation d'outils de microbiologie des sols. Appui terrain sur des projets de pédologie (carte des sols de l'Entre-deux-Mers, RMQS, valorisation de boues de dragage).
- Chargé de projet REMAS (2019-2021) : "Modélisation des risques d'émissions de gaz à effet de serre suite aux feux de forêt".
- Chargé de projet "BiodiverCité, volet #1" (2017-2019) : "Cartographie et inventaire pédologique des zones humides de Bordeaux Métropole".
- Intervenant dans le projet VASC (2019-2021) : "Valorisation Agronomique des Sédiments de la Charente".
- Intervenant dans le programme RMQS (2017-2021) : "Réseau de Mesures de la Qualité des Sols de France".
- Intervenant dans la cartographie pédologique de l'Entre-deux-Mers (CIVB). 2019-2020.
Compétences/techniques mises en œuvre : Gestion de projet, Microbiologie moléculaire, Terrain (prélèvements sol/litière, relevés végétation, GPS), Pédologie, SIG.

Collaborations notables : UMR Biogeco, la plateforme Biochem-Env (INRAE, Versailles), le laboratoire régional de contrôle des eaux de la ville de Limoges.

Contrats (CDD de droit public) financés, via l'école Bordeaux Sciences Agro, par la collectivité de Bordeaux Métropole, le programme Interreg SUDOE/ FEDER ou le FEADER (Fonds Européen Agricole pour le DEveloppement Rural).
2012 - 2017

Ingénieur de recherche au Département "Feed & Food" de Bordeaux Sciences Agro à Gradignan (Gironde, France). Responsable : Michel LE HÉNAFFMichel LE HÉNAFF [michel.lehenaff@agro-bordeaux.fr].
- Projets divers visant à mieux comprendre (mécanismes de transmission), détecter (qPCR) et lutter (désinfection, probiotiques, virus bactériophages) contre F. psychrophilum, bactérie affectant les truites d'élevage.
- Missions occasionnelles de transfert pour le privé au bénéfice du département Feed & Food.
- Missions occasionnelles de transfert pour le privé au bénéfice du département Feed & Food (2014-2021).
- Projet Resist3A (FEAMP), 2016-2017 :
- Projet Flavo (FEADER), 2012-2014 :
Compétences/techniques mises en œuvre : Gestion de projet, Microbiologie moléculaire & pasteurienne (bactéries, bactériophages), Aquaculture, Encadrement d'étudiants.

Travaux donnant lieu à des publications (publiées ou en cours de préparation)¹ et des conférences/posters^2,3,4.

Collaborations étroites avec la plateforme d'imagerie Bordeaux Imaging Center, le Laboratoires des Pyrénées et des Landes (LPL, ex-LD40, Mont-de-Marsan), le Groupement de Défense Sanitaire Aquacole d'Aquitaine (GDSAA, Mont-de-Marsan), diverses piscicultures d'Aquitaine ainsi que les fabricants de probiotiques Lallemand (Blagnac) et Cobiotex/Dietaxion (Pessac).

Contrats droit public financés, via l'école Bordeaux Sciences Agro, par le FEADER ou le FEAMP (Fonds Européen pour les Affaires Maritimes et la Pêche) ou contrats de droits privés financés, via l'ADERA, par des partenaires industriels.
2005 - 2011

Ingénieur de recherche au sein de l'équipe "Organogenèse du Fruit et Endoréduplication" (UMR 1332) à l'INRA de Villenave d'Ornon (Gironde, France). Responsable : Michel HERNOULDMichel HERNOULD [hernould@bordeaux.inra.fr].
- Etudes de la fonction de différents gènes de plantes-modèles (tomate, tabac, fraisier) potentiellement impliqués dans des processus développementaux d'intérêt agronomiques (floraison, taille/gout des fruits, teneurs en vitamines) ou académiques (développement de la fleur).
- Développement d'un test de détection précoce du potentiel floral du fraisier et mise en pratique dans le cadre d'une étude de l'impact de la fertilisation azotée sur la production de fruits.
- Élaboration et caractérisation de plants de tomate accumulant du potassium dans le fruit.
- Clonage et caractérisation, chez le Tabac (Nicotiana tabacum) et ses ancêtres (N. sylvestris et N. tomentosiformis), des séquences codantes et promotrices des diverses formes du gène "Superman" impliqué dans le développement de la fleur.
- Élaboration et caractérisation de plants de tomate surproduisant de la vitamine E dans le fruit.
Compétences/techniques mises en œuvre : Génétique inverse (génie génétique, biotechnologie végétale, phénotypage/génotypage, etc.), Biochimie (RMN), Encadrement de technicien, Gestion de projet.

Travaux donnant lieu à une publication⁵ et des posters⁶.

Collaborations notables : Centre Invenio de Douville en Dordogne, équipe "KaliPHruit" du laboratoire de Biochimie et Physiologie Moléculaire des Plantes de Montpellier, la plateforme Métabolome de Bordeaux.

Contrats financés, via Invenio (droit privé), par le FEADER ou, via l'INRA ou l'université de Bordeaux (droit public) par l'ANR Emergence ou le programme Eusol.
2001 - 2004

Chercheur doctorant au sein de l'équipe "Virologie végétale" (UMR 1332) à l'INRA de Villenave d'Ornon. Responsable : Olivier LE GALLOlivier LE GALL [olegall@bordeaux.inra.fr].
- Travaux de thèse consistant à identifier les gènes impliqués dans la capacité de certains virus à contourner les résistances de leurs plantes-hôtes.
- Identification des gènes viraux impliqués dans la capacité de certaines souches virales du LMV (virus de la mosaïque de la laitue) à infecter des variétés de laitue résistantes.
- Mise au point d'un test de détection spécifique de ces souches virales émergentes sur la base de cette cartographie fine.
Compétences/techniques mises en œuvre : Gestion de projet. Virologie moléculaire. Génétique inverse (bioinformatique de base, génie génétique, transgenèse/infection, génotypage/phénotypage).

Réalisations : Manuscrit de thèse. Publications^{7, 8}, posters et conférences.

Bourse de thèse (CDD de droit public) co-financée par l'INRA et la région d'Aquitaine.

2002

Stage de perfectionnement à l'Institut Armand Frappier à Laval (Québec, Canada). Responsable : Jean-François LALIBERTÉ.

Acquisition/perfectionnement de techniques de mutagénèse, aléatoire ou dirigée, par PCR.
Techniques utilisées ensuite dans le cadre de ma thèse.

2000 - 2001

Ingénieur stagiaire (DEA) au sein de l'équipe "Virologie végétale" (UMR 1332) à l'INRA de Villenave d'Ornon. Responsable : Frédéric REVERS.

Criblage de lignées d'Arabidopsis thaliana dans le but d'identifier, caractériser et cartographier de nouveaux gènes de résistance au virus du LMV (Lettuce mosaic virus, virus de la mosaïque de la laitue).

Rapport de stage. Publication⁷.

1999 - 2000

Technicien stagiaire (hors cursus) au sein de l'équipe "Organogenèse du Fruit et Endoréduplication" (UMR 1332) à l'INRA de Villenave d'Ornon. Responsables : Armand MOURAS et Michel HERNOULD.

Initiation à la biologie moléculaire, à la biotechnologie végétale (transgenèse, culture in vitro) et à l'histologie (hybridation in situ).

1993 - 1994

Opérateur de saisie/Archiviste (jobs estivaux) au GAN à Bordeaux-Lac (Gironde, France).

Assister les employés titulaires dans leurs tâches administratives simples (calculs de retraite, salaires, etc.) pendant les grandes vacances.
Travail d'archiviste (classer des documents, retrouver des documents à la demande, etc.) dans le service dédié à cette activité pendant les grandes vacances (le personnel titulaire en vacances est remplacé par de jeunes travailleurs "saisonniers").

2015

MOOC (cours en ligne) sur la plateforme France Université Numérique : « Initiation aux statistiques avec R », « Concepts et méthodes en épidémiologie », « Bioinformatics: Genomes and Algorithms ».

2004
Docteur en Sciences biologiques et médicales : École doctorale de l'université de Bordeaux 2 à Bordeaux (Gironde, France).

2001

Diplôme d'études approfondies (DEA) "Biologie - Santé" : École doctorale de l'université de Bordeaux 2 à Bordeaux.

1999

Maîtrise de Biologie Cellulaire et Physiologie : Université Victor Segalen de Bordeaux 2 à Bordeaux.

1998

Licence de Biologie Cellulaire et Physiologie : Université Victor Segalen de Bordeaux 2 à Bordeaux.

1996

Diplôme d'études universitaires générales (DEUG) "Biologie" : Université de Bordeaux 1 "Sciences et Technologies" à Talence (Gironde, France).

1994

Baccalauréat série D : Lycée Jean Monnet à Blanquefort (Gironde, France).

2021
Validated MAGIC and GWAS population mapping reveals the link between vitamin E content and natural variation in chorismate metabolism in tomato. The Plant Journal. Estanislao BURGOS, Maria Belen DE LUCA, Isidore DIOUF, Luis A. DE HARO, Elise ALBERT, Christopher SAUVAGE, Zhao J. TAO, Luisa BERMUDEZ, Ramon ASIS, Adriano N. NESI, Michel MATRINGE, Claire BREHELIN, Thomas GUIRAUD, Carine FERRAND, Isabelle ATIENZE, Joana JORLY, Jean-Pierre MAUXION, Pierre BALDET, Alisdair R. FERNIE, Leandro QUADRANA, Christophe ROTHAN, Mathilde CAUSSE & Fernando CARRARI. [Lien]
2015
Evaluation of glutaraldehyde, chloramine-T, bronopol, Incimaxx Aquatic® and hydrogen peroxide as biocides against Flavobacterium psychrophilum for sanitization of rainbow trout eyed eggs. Journal of Aquaculture Research & Development. Alexandra GRASTEAU, Thomas GUIRAUD, Patrick DANIEL, Ségolène CALVEZ, Valérie CHESNEAU, Michel LE HÉNAFF. [Lien]
2009
Involvement of the cylindrical inclusion (CI) protein in the overcoming of an eIF4E-mediated resistance against Lettuce mosaic potyvirus. Molecular Plant Pathology. Anas ABDUL-RAZZAK, Thomas GUIRAUD, Martine PEYPELUT, Jocelyne WALTER, Marie-Christine HOUVENAGHEL, Thierry CANDRESSE, Olivier LE GALL, Sylvie GERMAN-RETANA. [Lien]
2004
Specific detection of Lettuce mosaic virus isolates belonging to the “Most” type. Journal of Virological Methods. Martine PEYPELUT, Renate KRAUSE-SAKATE, Thomas GUIRAUD, Marcelo Agenor PAVAN, Thierry CANDRESSE, Francisco Murilo ZERBINI, Olivier LE GALL. [Lien]
2004
Les facteurs viraux restaurant la compatibilité entre un potyvirus et une plante dont l'eIF4E est non-permissif. Thèse de l'université de Bordeaux 2. Thomas GUIRAUD sous la direction d'Olivier LE GALL. [Lien]
2003
Multiple resistance phenotypes to Lettuce mosaic virus among Arabidopsis thaliana accessions. Molecular Plant-Microbe Interactions. Frédéric REVERS, Thomas GUIRAUD, Marie-Christine HOUVENAGHEL, Thierry MAUDUIT, Olivier LE GALL, Thierry CANDRESSE. [Lien]

Ingénieur Recherche et DéveloppementR & D spécialisé en Biologie moléculaire et génie génétique

Principales compétences

Biologie moléculaire

Génie génétique

Biotechnologie végétale

Microbiologie

Bioinformatique

Sciences de l'environnement

Gestion de projet scientifique

Informatique

Expériences

Formation

Publications

Autres communications

Centres d'intérêt