Génotype de la souche E. coli DB3.1

• F- : pas d'épisome F ni de mini-plasmide F'
• gyrA462 : résistance à la toxine ccdB
• endA1 : mutation empêchant la production d'endonucléases (nécessaire pour la production de plasmides)
• glnV44 : tRNA du codon Amber qui apporte la glutamine, nécessaire pour la production de phage
• Δ(sr1-recA) : délétion entrainant l'absence de métabolisation du sorbitol (sr1) et la recombinaison homologue recA (nécessaire pour multiplier des séquences répétées de plus de 50pb).
• mcrB : Affecte le système de restriction spécifique des méthylcytosines.
• mrr : Affecte le système de restriction spécifique des cytosines et adénines méthylées.
• hsdS20(rB-, mB-) : double mutation abolissant à la fois la restriction de sites non méthylés par les enzymes internes EcoB1 et EcoK1 et la méthylation des sites de restriction pour ces enzymes. L'ADN peut être ensuite coupé dans un contexte génétique WT.
• ara14 : ne peut pas métaboliser l'arabinose.
• galK2 : ne peut pas métaboliser le galactose mais rend la souche résistante au 2-deoxygalactose.
• lacY1 : mutation de la perméase du lactose.
• proA2 : nécessite de la proline pour pousser.
• rpsL20(Smr) : mutation d'une protéine ribosomale conférant la résistance à la streptomycine.
• xyl5 : ne métabolise pas le xylose.
• Δleu : (à vérifier) nécessite de la leucine.
• mtl1 : ne peut pas métaboliser le mannitol.