Une solution RNAse-free est une solution qui a été débarrassée des éventuelles contaminations en RNAses susceptibles de dégrader les ARNs que l'ont extrait ou utilise dans certains protocoles. Il existe quatre méthodes courantes pour détruire/inactiver ces RNAses :

• Autoclavage à 130°C pendant 1 heure :

Aussi simple et sûre semble-t-elle être, cette méthode est actuellement (fin 2008) à proscrire au laboratoire étant donné que le petit autoclave ne supporte pas cette température trop longtemps.

• Traitement au DEPC :

Cette méthode utilise les propriétés du diéthylpyrocarbonate (DEPC) qui détruit les protéines et bien d'autres molécules en s'attaquant aux liaisons covalentes -N, -O et -S (ou, selon Wikipedia, s'attaque spécifiquement aux histidines et tyrosines des protéines). Ce produit étant dangereux, toute manipulation se fait sous hotte aspirante.

• • On ajoute du DEPC dans la solution à traiter en le diluant au 1000ème.
  • On laisse sous agitation magnétique pendant toute une nuit et on autoclave ensuite 20min à 120°C pour détruire le DEPC.

 

• Traitement au chloroforme : à réserver au matériel qui peut supporter ce traitement (notamment celui en verre).

 

• Traitement à la soude : incuber quelques heures à une nuit le matériel dans une solution de NaOH 0.1M EDTA 0.1M.

Une solution RNAse-free obtenue de cette manière est aussi DNAse-free.