Des cultures de bactéries peuvent être faites en milieu liquide, et ce dans le but de réaliser une extraction de plasmide ou de créer des bactéries électrocompétentes, par exemple.
Comme les souches de l'espèce Escherichia coli utilisées en génie génétique ont une croissance rapide et sont le plus souvent utilisées sur des milieux sélectifs (ampicilline, kanamycine, etc.), on peut parfois se permettre de travailler en condition non stérile (sur la paillasse, en ouvrant/fermant rapidement tubes et boites de pétri). Les contaminations (champignons, bactéries) pousseront beaucoup moins rapidement que la souche d'intérêt. Ca ne fonctionne pas dans toutes les situations (comme la préparation de bactéries électrocompétentes qui nécessite que les bactéries soient propres pour les futures utilisations) et il faut surtout éviter ça pour la manipulation de bactéries dites fastidieuses (qui poussent lentement) comme Agrobacterium tumefasciens ou Flavobacterium psychrophilum ou des bactéries sporulentes qui peuvent contaminer le plan de travail (exemple : bactéries du genre Bacillus).
Préparation de la culture liquide :
- Dans un tube à vis (type Falcon 50 ml), ajouter maximum 1/5ème du volume du récipient en milieu de culture liquide.
- Si nécessaire, ajouter une quantité spécifiée d'antibiotique de sélection (dépend du génotype de la souche et du ou des plasmides qu'elle contient).
- Sur la boîte de milieu solide, repiquer une colonie isolée à l'aide d'une pointe de pipette ou d'un cure-dent stérile stérile. Mieux, à l'aide d'une öse jetable ou stérilisée à la flamme. ATTENTION : Si vous n'utilisez pas d'antibiotique de sélection, pensez à bien vous désinfecter les mains à l'aide d'un solution hydroalcoolique, à travailler en condition stérile (hotte à flux laminaire ou au bec bunsen) et utilisez une öse plutôt qu'une pointe de pipette ou un cure-dent qui sera contaminé par l'extrémité par laquelle vous l'aurez tenu.
- Placer le récipient dans une étuve à température adéquate (37 °C en routine pour une culture d'E. coli), en agitation (150 rpm) et en optimisant la surface d'interface avec l'air pour maximiser l'oxygénation (ie. en penchant les tubes de culture).