L’ADN génomique de plante est extrait selon la méthode de Dellaporta et al. (1983). Le matériel végétal (feuilles) est broyé à l’aide d’un pilon dans un mortier en présence d’azote liquide. Le broyat (1 g) est placé en présence de 10 mL de tampon d’extraction (Tris-HCl 100 mM pH 8, EDTA 50 mM pH 8, NaCl 500 mM, Beta-mercaptoéthanol 10 mM). Le mélange est homogénéisé au polytron à vitesse moyenne. Après addition de 2,7 mL de SDS 10% (p/v) (0.432€/échantillon), le mélange est vortexé puis incubé pendant 10 min à 65°C afin de rompre les parois végétales. L’addition de 3,3 mL d’acétate de potassium 5 M pH 7, suivie d’une incubation de 20 min à 4°C, permet d’éliminer les protéines et les polysaccharides qui forment un précipité insoluble. Après centrifugation (20 min, 25000 g), le surnageant est filtré sur tissu Miracloth et les acides nucléiques sont précipités à l’isopropanol pendant 30 min dans la glace. Après centrifugation (15 min, 20000 g), le culot d’acides nucléiques est séché puis repris dans 400 μL d’une solution TE (Tris-HCl 50 mM pH 8, EDTA 10 mM pH 8). Le culot ainsi repris est soumis à une déprotéinisation par extraction au phénol-chloroforme (1:1) suivie d’une extraction au chloroforme-alcool isoamylique (24:1). Les acides nucléiques sont ensuite précipités à l’éthanol 95% (2,5 volume) à -20°C, en présence d’acetate sodium 0,3 M pH 5,8 (0,1 volume). Le culot final est rincé à l’éthanol 70%, séché sous vide et repris dans 400 μL de TE. Un traitement à la RNase A (20 μg/mL) est effectué, suivi d’une nouvelle déprotéinisation et précipitation à l’éthanol.

    La concentration et la qualité de l’ADN génomique sont déterminées par spectrophotométrie à 260 nm et 280 nm, et après analyse par électrophorèse en gel d’agarose.